Het bevoegd gezag is opdrachtgever. Na overleg tussen opdrachtgever en (interne of externe) onderzoekers wordt de opdracht tot onderzoek schriftelijk vastgelegd.
De opdracht bevat in ieder geval:
de aanleiding
een duidelijk omschreven doelstelling
de onderzoeksvragen
de onderzoekmethoden
de vermelding dat het bevoegd gezag /de opdrachtgever instemt met het gebruik van onderzoeksmethodes door de onderzoekers
de vermoedelijke duur van het onderzoek. Als tijdens het onderzoek blijkt dat er meer tijd nodig is, bijv. omdat de complexiteit of omvang groter is dan vooraf geschat wordt de opdrachtgever daarvan tijdig op de hoogte gebracht.
de omvang en inzet van de onderzoekscapaciteit
de met het onderzoek gemoeide kosten
Bij het inschakelen van een externe partij moet ook vastgesteld worden van welke bevoegdheden deze gebruik kan maken. Het is helder dat in alle gevallen binnen de grenzen van het protocol integriteitsschendingen wordt gewerkt.
Vindt de opdrachtgever - bijv. na het verkrijgen van de voortgangsrapportages en na overleg met de onderzoekers - dat het onderzoek moet worden uitgebreid, dan wordt ook die uitbreiding schriftelijk vastgelegd in een aanvullende opdrachtomschrijving.