De wet BIBOB is niet alleen van toepassing op het aanvragen van een vergunning, ook kan de gemeente een vergunning intrekken op grond van de wet BIBOB. Het OM kan hierin een rol spelen als tipgever. De afdeling vergunningen zal aan de hand van dezelfde indicatoren als bij een vergunningaanvraag na gaan of er redenen zijn de integriteit van de vergunninghouder in twijfel te trekken. Alvorens een vergunning kan worden ingetrokken moet een advies van het bureau BIBOB zijn ingewonnen en wordt de betrokkene gehoord.