De commissie is belast met en verantwoordelijk voor de uitvoering, begeleiding en sturing van het onderzoek volgens de door haar vastgestelde onderzoeksopzet.
De commissie beoordeelt of het wenselijk is de raad tussentijds te informeren.
De commissie is bevoegd bij alle leden van het gemeentebestuur en bij alle ambtenaren de mondelinge en schriftelijke inlichtingen in te winnen die zij nodig acht voor de uitvoering van de onderzoeken. De leden van het gemeentebestuur en de ambtenaren van de gemeente zijn verplicht de gevraagde inlichtingen binnen de door de commissie redelijk gestelde termijn te verstrekken. De commissie is ter vervulling van haar taak ook bevoegd onder wettelijk bepaalde voorwaarden onderzoek te verrichten bij derden die een financiële band hebben met de gemeente.
De commissie vergadert zoveel als zij nodig acht, ter bespreking van procedurele en inhoudelijke aspecten van het onderzoek.
De commissie vergadert in beslotenheid, haar rapporten zijn openbaar. Op grond van de belangen genoemd in artikel 10 van de Wet Openbaarheid van Bestuur kan de commissie rapporten die aan de raad worden voorgelegd of gedeelten daarvan als geheim aanmerken.
De commissie kan openbare informatieve vergaderingen beleggen.
De commissie legt de resultaten van haar onderzoek vast in een concept onderzoeksrapport. De commissie stelt de betrokkenen in de gelegenheid om binnen een door haar te stellen termijn, die ten minste 10 werkdagen bedraagt, aan de commissie kenbaar te maken of en zo ja, welke feitelijke onjuistheden in het concept onderzoeksrapport staan vermeld. Betrokkenen zijn degenen wier taakuitvoering (mede) onderwerp van onderzoek is of is geweest. Na het verstrijken van deze termijn worden gebleken feitelijke onjuistheden in het concept onderzoeksrapport gecorrigeerd. Vervolgens wordt het definitieve onderzoeksrapport inclusief conclusies en aanbevelingen aan het college voorgelegd voor een bestuurlijke reactie.
Na vaststelling door de commissie worden het onderzoeksrapport, de nota met conclusies en aanbevelingen en de bestuurlijke reactie van betrokkenen op het rapport zo spoedig mogelijk, onder toezending van een afschrift aan het college en betrokkenen, aan de raad aangeboden.
Besluiten worden bij meerderheid van stemmen en in aanwezigheid van minimaal tweederde van de commissieleden genomen. Als de stemmen staken heeft de voorzitter de doorslaggevende stem.
De commissie evalueert jaarlijks haar werkzaamheden. Deze evaluatie is onderdeel van het wettelijk verplichte jaarlijkse verslag.
In het onderzoeksprotocol van de rekenkamercommissie is haar werkwijze verder uitgewerkt.