De Havendienst Harlingen zal van ieder zeeschip dat valt onder het systeem van indirecte financiering een afvalheffing toevoegen op de factuur van de havengelden. Ieder schip dat participeert in het systeem van indirecte financiering verkrijgt een afgifterecht van € 50,– voor de afgifte van Annex I en V afvalstoffen.
Buiten het afgifterecht voor schepen vallen de kosten ten gevolge van:
de afgifte van lading gebonden afval (ladingresiduen);
afwijkingen van de acceptatiecriteria van de inzamelaar
langere afhandelingstijd dan 30 minuten;
afgifte buiten standaard servicetijden (standaard servicetijden ma. t/m za. van 8.00 -17.00 uur).
De financiële afhandeling van de afvalafgifte is een zaak tussen de inzamelaar en de ontdoener (directe financiering).
Na afronding van de inzamelactiviteiten ondertekenen de ontdoener (het schip) en de inzamelaar beiden het S-formulier. De inzamelaar stuurt de rekening naar de ontdoener en stuurt een kopie van de rekening naar de Havendienst Harlingen. De kopie van de rekening dient, samen met het S-formulier, uiterlijk binnen 8 dagen na afronding van de inzamelactiviteiten bij de Havendienst Harlingen te worden ingediend om voor creditering van de indirecte financiering in aanmerking te komen.
De Havendienst controleert de gegevens op de rekening en het S-formulier. Vervolgens worden de afvalheffing en administratiekosten op de factuur van havengelden geplaatst. De financiële vergoeding van het afgifterecht zal als credit op de factuur van de havengelden worden geboekt. Indien een schip lagere kosten maakt dan de kosten die vallen binnen de voorwaarden van indirecte financiering (dus lager dan het verkregen afgifterecht), zullen slechts die specifieke kosten vergoed worden.
Artikel 6a lid 5 van de Wvvs schrijft voor dat de betaling pas kan worden verricht als de verklaring van verwerking bij de Havendienst Harlingen ingediend is. Omdat er vaak veel tijd zit tussen inname en eindverwerking, wordt er door de Havendienst na het ontvangen van de afgifteformulieren (S-formulier) en de kopie van de nota een voorlopige betaling/creditering verricht aan de agent/het schip. Periodiek worden er door de havenontvangstinstallaties verklaringen van verwerking en accountantsverklaring(en) toegezonden aan de Havendienst. Na controle van deze gegevens, wordt overgegaan tot een definitieve afrekening. Indien de gegevens niet kloppen, dient de havenontvangstinstallatie het verschil te betalen aan de Havendienst. Vervolgens bepaald de Havendienst of dit verschil uit het directe of het indirecte deel van de rekening komt. Indien dit het indirecte deel betreft, is de vergoeding voor de Havendienst. Indien de vergoeding ten goede komt voor het directe deel van de rekening, wordt dit bedrag alsnog aan de agent/het schip overgemaakt.