De inrichtingsprincipes zijn de volgende uitgangspunten op basis waarvan de organisatie is opgebouwd.
De organisatie - en de aan Delft verbonden ondernemingen - is verdeeld in clusters. Daarbij is de inhoud van het beleidsterrein leidend. Er is samenhang tussen de beleidsmatige taken en de uitvoerende taken. Beide zijn vertegenwoordigd in een cluster;
Er is een hiërarchische structuur bestaande uit de lagen; de gemeentesecretaris/algemeen directeur, de gemeentedirecteuren, de (adjunct-) afdelingshoofden en teamleiders;
De clusters Interne Dienstverlening en Bestuur leveren diensten aan de gehele organisatie. De afdeling programma’s en projecten is ingedeeld bij het cluster Bestuur.