Van het havengeld zijn vrijgesteld:
overheidsschepen;
hospitaalschepen zijnde:
de Zonnebloem met rijnvaartnummer; 02327391;
de J. Henry Dunant met rijnvaartnummer; 02322387;
de Prins Willem Alexander met rijnvaartnummer; 02325776;
een tot de inventaris van een schip behorend werkvlot met een oppervlakte van maximaal 8m² of een roeiboot of opblaasbare boot, al dan niet met aanhangmotor, behorende bij een schip en aansluitend in gebruik tot onmiddellijke scheepsdienst of tot het overbrengen van opvarenden;
schepen die zijn opgenomen als Varend Monument (categorie A) in het nationaal register van varende monumenten (NRVM) van de Federatie van Varend Erfgoed Nederland (FVEN) en die niet voor commerciële doeleinden en/of bedrijfsmatig worden geëxploiteerd, voor ten hoogste een tijdvak van drie dagen per jaar;
zeeschepen, welke de gemeente aandoen uitsluitend om zieken of doden aan land te zetten;
schepen die worden gebruikt ten behoeve van het onderhoud, de verbetering en de uitbreiding van de in deze verordening bedoelde wateren, kaden en werken, voor zover deze worden uitgevoerd in opdracht van de gemeente;
schepen die deelnemen aan de door de Vlootschouw Commissie Den Oever georganiseerde Flora- en Visserijdagen, gedurende de Flora- en Visserijdagen.
Het college van Burgemeester en Wethouders kan vaartuigen vrijstelling geven van de betaling van havengelden. Het college van B&W kan monumentaal varend erfgoed vrijstelling geven van de betaling van havengelden, mits er regelmatig onderhoud wordt gepleegd en dus als zodanig in stand worden gehouden. Het college van B&W geeft in ieder geval de Wieringer aken WR4, WR173 en WR179, de Wieringer skuut WR60 en de Kolhorner ansjovisjol KH44 vrijstelling voor betaling van havengelden.