De rekenkamer stelt een onderzoeksprotocol vast. In dit protocol beschrijft de rekenkamer in ieder geval hoe zij de kwaliteit en onafhankelijkheid van de begeleiding en uitvoering van extern onderzoek borgt.
De rekenkamer is verantwoordelijk voor de uitvoering van het onderzoek volgens de vastgestelde onderzoeksopzet met inachtneming van het onderzoeksprotocol.