De concerncontroller heeft eigenstandige bevoegdheden. De analyses en adviezen van de controller kunnen en mogen strijdig zijn met de belangen van het managementteam of een individueel afdelingshoofd, afhankelijk van de gemaakte afspraken in het controlplan.
De concerncontroller heeft een onafhankelijke lijn naar het bestuur en kan zonodig het college van burgemeester en wethouders informeren en of adviseren.