De griffier draagt een ambtelijk secretaris voor in overleg met de werkgeverscommissie. In Eemsdelta is de secretaris van de rekenkamercommissie onderdeel van een combinatiefunctie binnen de griffie. Omdat de voordracht een op de griffie werkzame ambtenaar betreft, besluit de raad tot het aangaan van de arbeidsovereenkomst.
De secretaris ondersteunt de rekenkamer bij de uitvoering van haar taken en vormt de verbinding tussen de rekenkamer, extern in te huren onderzoeker(s) en de ambtelijke organisatie. De ondersteuning voor de rekenkamer bedraagt gemiddeld 4 uur per week.