Wanneer de ambtenaar die gebruik maakt van deze regeling langdurig arbeidsongeschikt wordt wegens ziekte, wordt het recht op doorbetaling zoals bepaald in artikel 7:3 ARGA berekend over het salaris en toegekende salaristoelage(n) vóór deelname aan deze regeling. Hierbij geldt dat de ambtenaar nooit een hoger bedrag krijgt doorbetaald dan dat hij op grond van deze regeling krijgt als hij niet ziek zou zijn geweest.
De re-integratie bij ziekte richt zich op de omvang van de verminderde arbeidsduur.