De haven van Harlingen bestaat uit zowel een handels-, visserij- als recreatiehaven. De haven van Harlingen bestaat uit de Noorderhaven, de Zuiderhaven, het Dok, de Nieuwe Willemshaven, de Visserijhaven , de Industriehaven en de Nieuwe Industriehaven. De havens van Harlingen liggen ‘buitendijks’. In het verleden werden de havenuitbreidingen in zee gerealiseerd, bij de aanleg van de Industriehaven werd hier echter van afgezien. Deze haven ligt achter de zeedijk, toch is de Industriehaven een buitendijkse haven. In 2003 is de Industriehaven uitgebreid. Deze uitbreiding is eveneens achter de zeedijk aangelegd waarna de bestaande zeewering werd doorgestoken en ook het nieuwe gedeelte van de Industriehaven een buitendijkse haven is geworden.