Gezien de integrale bodemfinanciering was het wenselijk een integraal bodemprogramma te maken. Hierin zijn de uitgaven gepland van de apparaatskosten en de projecten in het landelijk en stedelijk gebied. Op basis van de bestaande beleidskaders en het Bodemconvenant zijn er verplichte onderdelen aangewezen. Uiteraard komen daar de verplichtingen uit lopende projecten bij. Dit leidt tot de volgende indeling van het bodemprogramma:
- - apparaatskosten;
- - lopende saneringen;
- - aanpak werkvoorraad;
- - planfiguur Ondergrond;
- - planfiguur Gebiedsgericht Grondwaterbeheer.